目前，菌肥中所用的菌種一般屬于中溫性微生物，土壤溫度在25-37℃時，最利于菌的生長和繁殖，一旦土壤溫度超過37℃，菌的生長會明顯變緩甚至停滯，菌肥效果也將受到影響。但生長停滯不代表菌的死亡，當(dāng)溫度正�；謴�(fù)且土壤濕度在50%左右時，菌將恢復(fù)生長及繁殖功能。如果在高溫地區(qū)施用菌肥，建議企業(yè)通過分離篩選出更耐高溫的菌種，添加到菌肥中確保菌肥效果。

此外，強降雨也會讓菌肥效果降低。大多數(shù)微生物菌肥中的菌都是有氧細(xì)菌，需要有氧呼吸。如果土壤積水時間過長，會影響菌肥效果，必須及時排干積水。此外，過多的積水會讓菌懸浮到水中一部分，被沖掉，從而影響菌肥效果。

下面列舉幾點注意事項：

注意1：氮、磷、鉀總含量超過8%時與菌混合，會抑制菌的活性。菌與化肥混合時，一定要注意肥料中的氮、磷、鉀總養(yǎng)分不要超過8%，一旦超過會抑制菌的活性，如果氮、磷、鉀總養(yǎng)分大于8%，建議隨用隨混。目前，有些廠家的復(fù)合微生物菌肥中的氮、磷、鉀總養(yǎng)分達(dá)到10%以上，有的甚至達(dá)到25%以上，這對于一般的菌種來說，都會造成菌活性降低甚至造成部分死亡。但如果廠家選用的是耐化肥的菌種，就可以保證菌肥肥效。

注意2：不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥(如硫酸鉀等)以及稻草灰混合用。因為這些藥、肥，很容易殺死生物菌�；蛘呦仁┚�肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。還應(yīng)防止與未腐熟的農(nóng)家肥混肥。

注意3：對于已多年施用化肥的田塊，施用生物菌肥時不能大量減少化肥和有機肥的施用量，因農(nóng)作物對化肥產(chǎn)生了依賴性，用生物菌肥取代化肥不能一下子適應(yīng)。因此，其取代量應(yīng)做到第一、第二、第三年分別取代30%、40%和60%，磷、鉀肥只能補足，不能減少。

注意4：在施用方法上，建議采用溝施、窩施的方式，一定要將菌肥蓋在土壤里，避免陽光直射，紫外線會殺死細(xì)菌；此外，不建議沖施微生物菌肥，因為加水稀釋后菌群會被沖散，影響施用后的效果。對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫能殺死生物菌。對于翻漿的水田，一般不用撒施，用噴霧的方法效果會好些。

注意5：高溫過高、過低、干旱條件下的農(nóng)作物田塊不建議施用微生物菌肥。

注意6：選擇微生物菌肥一定要根據(jù)作物進(jìn)行選擇。例如，針對大田作物，如水稻、玉米、小麥等，建議選擇復(fù)合微生物肥料。因為復(fù)合微生物肥料中既包含了菌、又包含氮、磷、鉀養(yǎng)分，以及有機質(zhì)，使用起來更方便；在單獨使用氮肥、磷肥或鉀肥的地塊，可以配合施用微生物菌劑，起到促生長、抗病抗蟲等作用；針對瓜果蔬菜，建議使用生物有機肥，改善瓜果蔬菜的口感和品質(zhì)。